近日，湛江实验站橡胶及林下经济科研团队在大量调查阳春砂仁表型性状基础上，开展了分子标记与表型的全基因组关联分析，筛选与砂仁生长性状相关联的分子标记及候选基因，为砂仁复杂数量性状的遗传学研究和分子标记辅助育种提供借鉴。

       阳春砂仁（Amomum villosum Lour.）为姜科豆蔻属多年生草本植物，属于常用大宗药材，是我国四大传统“南药”品种之一，以及“粤八味”和“十大广药”品种之一，具有悠久的药用历史和极高的药用价值。然而，阳春砂仁生长及产量等性状为多基因控制，其相关遗传研究相对滞后，因此，本研究以75份阳春砂仁种质资源（目前报道为止资源最多，收集范围最广）为材料，进行12个生长性状的调查统计分析，利用71对多态性的 SSR分子标记扫描群体基因型，在分析连锁不平衡和群体结构的基础上，进行SSR标记与生长性状的关联分析，鉴定与生长性状密切相关遗传标记，并根据连锁标记选择候选基因，开展荧光定量表达模式分析，相关工作旨为砂仁复杂数量性状的遗传学研究和分子标记辅助育种奠定基础。

        该研究成果以“Genome-wide association study of the loci and candidate genes associated with agronomic traits in Amomum villosum Lour.”为题发表于知名农艺学期刊《PLOS One》（中科院分区三区）。湛江实验站李文秀助理研究员与罗萍研究员为共同第一作者，南亚热带作物研究所贺军军副研究员为论文的通讯作者。该研究由2023年省级乡村振兴战略专项种业振兴行动项目“南药春砂仁种质资源圃运行维护”， （2023-MBH-00-023）、南药道地性高品质生产与功能开发技术“十四五”广东省农业科技创新十大主攻方向“揭榜挂帅”项目（2022SDZG07）和国家天然橡胶产业技术体系（CARS-33-GD2）共同资助完成。

       论文链接：https://doi.org/10.1371/journal.pone.0306806